脑放电波

← 脑放电波14 jun · 1 u 03 min

把我的74G基因数据塞进Mac,加上10年健康数据,AI发现了什么?-对谈生物骇客段誉-Vol 101

把我的74G基因数据塞进Mac,加上10年健康数据,AI发现了什么?-对谈生物骇客段誉-Vol 10114 jun1 u 03 min

曾经基因测序和分析,普通人只能浅尝辄止,但今天你靠电脑就可以解读在99% 相同的基因背后,你和他人的区别是什么?AI 能从30 亿个基因碱基对中分辨这些。同样,你也可以上传十年的体检数据和手表数据,结合你的日历与照片,这里面包含了更多信号:哪些信号代表疲惫?体检中持续报警的指标,是不是和遗传有关?

段誉往 Mac mini 上摞了两个风扇,三天三夜没关。74 个 GB 的 FASTQ 文件从华大服务器上拖下来,Claude 做的 planning,Codex 跑执行——比对、投票、压缩成 172 兆、461 万处跟标准基因组不一样的点位。一个人的基因数据,全部本地化。

觉得这事太硬核对吧?Nixon 那半边门槛低得多。Apple Watch 的数据用 50 块钱的第三方 APP 导出,加飞书日历,加一个叫 Looki 的 AI 相机——全部丢给 agent。一小时出报告。深度睡眠四年翻了三倍、喝啤酒第二天静息心率涨 13%、主持的会身体轻松,参加的会越听越累——全是数据告诉你的。

本期嘉宾段誉,运动健康领域投资人、生物骇客、脑放电波老朋友。这是他第四次上节目,每次身份都不一样。跟他聊了整整一个小时——从厨房里的纳米孔测序仪,到你手表的 100 多项数据怎么用 AI 一次全解读。

00:26 74GB 基因数据,怎么从测序到本地的

只要愿意放弃隐私,就有更多 insight。——段誉

起点是一个瑞典老哥在自家厨房用纳米孔测序仪(三代长读数)完成全基因组测序,再用 Mac mini 本地分析。段誉被震撼了,但他的厨房放不下那台几万美金的仪器。他问 Claude 有没有替代方案——国内华大 WGS(全基因组测序)官方价 6999,1 万以内搞定。

跟 23andMe 那种「基因卡」(300 元查两三百个网红点位)完全不同。WGS 是 30 亿个碱基对全测,同一个点位测 46 次再投票。吐 4-5 口唾液寄走,10 天出报告。华大给的报告 300 多页——重点是药物敏感性,几百种药的代谢能力一目了然。

段誉要的不是报告,是原始数据。「以后人类对基因有任何新认知,我自己跑一下就行。」华大客服口头答应给 FASTA 文件,然后就没下文了。他让 Claude 写了封维权邮件,抄送投资者关系部和董秘——第二天 QQ 邮箱收到下载链接。74GB 一个文件,传了两三个小时。

07:42 为什么要原始数据?因为今天不懂的,明天可能懂

Claude 先做 planning——列出七八步流程、每步耗时、把重的任务放晚上跑、交互的留早上问。生成的 sh 文件甩给 Codex,Mac mini 加两个风扇连跑三天。从 FASTQ 碎片→比对标准基因组→40 多次投票纠错→压缩成 172MB 的 VCF 文件——461 万处变异。「这个 172 兆的文件,就是我之所以是我。」

接下来最重要的一步:用 dbNSFP 词典做注释。这本词典 47GB——全球科学家把已知的基因变异解读汇总在一起,相当于「基因界的维基百科」。拿自己 172 兆的数据去比对 47GB 的词典,十几分钟出结果。段誉还跑了一个更前沿的工具——AlphaGenome,专门预测非编码区(占 90% 的不翻译成蛋白质的部分)的变异含义。